Der Grundriss des Innenraums hat die Form eines lateinischen Kreuzes. Das Kirchenschiff der Kathedrale, das vom Eingang ausgeht, ist auffallend lang und folgt einem schwarz-weißen Farbcode. Er ist durch eine Kolonnade aus kräftigen Steinsäulen, die in denselben Farben gestreift sind, in drei Gänge unterteilt. Auf den Kapitellen dieser Säulen findet man Statuen von allegorischen Figuren und Tieren. Dort, wo die Säulen die darüber liegenden Bögen erreichen, beginnt eine horizontale Leiste mit 172 Büsten von Päpsten aus dem 15. und 16. Jahrhundert, die den oberen Rand des Kirchenschiffs bis zum Presbyterium durchzieht. Unterhalb dieser Büsten befinden sich Gesimse mit den Gesichtern von 36 römischen und byzantinischen Kaisern, die parallel zueinander verlaufen.