De indeling van het interieur heeft de vorm van een Latijns kruis. Het schip van de kathedraal, dat begint bij de ingang, is bijzonder lang en volgt een zwart-witte kleurcode. Het is in drie gangen verdeeld door een zuilengalerij van forse stenen pilaren die in dezelfde kleuren zijn gestreept. Op de kapitelen van deze pilaren vind je beelden van allegorische figuren en dieren. Waar de pilaren de bogen bereiken, begint een horizontaal lijstwerk van 172 bustes van pausen uit de 15e en 16e eeuw die de bovenste richel van het schip helemaal naar het priesterkoor leidt. Onder deze bustes zijn kroonlijsten met de gezichten van 36 Romeinse en Byzantijnse keizers die parallel lopen.